Отец Сергей Бондарчук — актёр и режиссёр, известен по поставленному им фильму «Война и мир», где сыграл роль Пьера Безухова.
Мать Скобцева Ирина Константиновна — актриса кино.
Родная сестра Елена Бондарчук — актриса.
Сестра по отцу Наталья — актриса и кинорежиссёр, известна по фильму «Солярис».
Жена Светлана — телеведущая, главный редактор журналов «HELLO!» и «Icon».
Сын Сергей 1992 года рождения. Дочь Варвара 2001 года рождения.
В интервью журналу «Esquire» об отношении к партии «Единая Россия» заявил :
Я не являюсь членом «Единой России» или какой бы то ни было другой политической партии. Я поддерживаю политику Владимира Владимировича Путина и Дмитрия Анатольевича Медведева, участвую в форуме «Стратегия-2020», но состоять в каких-то партиях не намерен.
Через две недели после интервью Ф. Бондарчук вступил в ряды «Единой России».
Член Общественного Совета Молодой гвардии Единой России.
В одном из интервью признался что единственным его другом является российский бизнесмен чеченского происхождения Руслан Байсаров:
Фёдор Бондарчук — владелец трёх ресторанов в Москве (некоторые — совместно со Степаном Михалковым и Аркадием Новиковым): «Vaниль», «Вертинский», «Bistrot». В 2010 году совместно с другими рестораторами открыл в Москве кондитерскую «Булка».
В сентябре 2009 года запустил ресторанный бизнес в Екатеринбурге — открыл два ресторана и кондитерскую.