Во время его правления лейтенант Хосе Хоакин Морага заложил Сан-Франциско на месте, выбранном Хуаном Баутиста де Анса в 1776 году. Позднее, также Хуаном Баутиста де Анса, по инициативе вице-короля Антонио Марии де Букарели, был основан г. Сан-Хосе — первое поселение в колонии Новая Калифорния (позднее переименованной в Верхнюю Калифорнию). По настоянию Фелипе де Неве была основана миссия на месте будущего Лос-Анджелеса. Фелипе де Неве противостоял Хуниперо Серре в вопросах секуляризации миссий и распределения земель солдатам и новообращённым.