В 1406 году, когда скончался его старший брат Энрике III Кастильский, Фернандо отказался от кастильской короны, а вместо этого стал вместе с вдовой Энрике — Екатериной Ланкастерской — регентом при малолетнем Хуане II. На этой должности проявились его административные способности во внутренних делах.
Во время войны с Гранадским эмиратом в 1410 году Фернандо захватил город Антекера, по названию которого получил своё прозвище.
Когда Мартин I Арагонский — его дядя по матери — умер, не оставив законного наследника, то в 1412 году, в соответствии с компромиссом Каспе, Фернандо стал королём Арагона. Его соперник, Хайме II Урхельский, воспротивился этому решению, и Фернандо присоединил графство Урхель к Арагонскому королевству.
Фернандо I ввёл для наследника арагонской короны титул «принц Хиронский».
Самым заметным достижением его краткого правления стало его согласие в 1416 году на смещение антипапы Бенедикта XIII, что способствовало завершению Великого западного раскола, терзавшего римско-католическую церковь в течение 40 лет.
Фернандо I Арагонский похоронен в монастыре Поблет. Лоренцо Валла написал официальную биографию Фернандо I — «Historiarum Ferdinandi regis Aragonum libri sex» («О деяниях Фердинанда, короля Арагона»).
В 1393 году Фернандо женился на Элеоноре Альбукерке, и у них было семь детей: