Фернанду не пожелал жениться на дочери кастильского короля, но соблазнил красавицу Леонору Теллеш де Менезеш (ум. 1386), жену португальского дворянина Лорензо де Куньи, развел её с мужем и сам женился на ней в 1371 году. Новая королева была очень умна, старалась привлечь к себе народ лаской и щедростью, но большинство португальцев всегда относилось к ней с неприязнью.
От брака родилась единственная дочь Беатриса.
Так как после своей смерти Фернанду не оставил наследников, на нём прервалась прямая ветвь Бургундской династии. После его смерти началось португальское междуцарствие.