Сын врача и актрисы, учился в Мюнхене и Цюрихе. C 1884 вошёл в круги мюнхенского модерна. После смерти отца (1888) унаследовал значительное состояние. Как драматург испытал влияние Бюхнера, Ибсена, Ницше, Стриндберга, Гауптмана. С 1896 сотрудничал с мюнхенским сатирическим журналом Симплициссимус. Писал тексты для политического кабаре.
У Ведекинда была любовная связь с австрийской писательницей, бывшей женой А. Стриндберга Фридой Уль, у них родился сын.
В 1906 Ведекинд женился на актрисе Тилли Нойес (1886—1970), обе их дочери, Памела (1906—1986) и Кадидья (1911—1994), стали актрисами, актрисой стала и дочь Памелы Карола Ренье (род. 1946).
На основе драм Ведекинда «Дух земли» и «Ларец Пандоры» Альбан Берг создал оперу Лулу (осталась незаконченной, ее завершил в 1979 Фридрих Церха). По «Ларцу Пандоры» снял одноименный фильм Георг Вильгельм Пабст (1929, в главной роли Луиза Брукс, роль Лулу в кино исполняла также Аста Нильсен, 1923).
Фильм Лулу снял в 1980 Валериан Боровчик.
В 1999 драму «Пробуждение весны» поставил в Москве Роман Виктюк. В 2006 мюзикл на ее основе с огромным успехом шел на Бродвее в театре Юджина О’Нила (премия Тони, запись получила премию Грэмми, 2008).
В 2008 оперу Берга Лулу поставил в московской «Геликон-опере» Дмитрий Бертман.
В 2011 известными рок-музыкантами - Лу Ридом и группой Metallica - выпущен альбом «Lulu», выдержанный в стилистике авангардного рока/метала.