Окончил Парижскую консерваторию, удостоившись в 1815 г. Римской премии за кантату Энона. В 1819 г. был назначен королевским органистом и преподавателем консерватории; на преподавательской должности оставался вплоть до 1871 г. — среди учеников, в частности, были Камиль Сен-Санс, Эмиль Паладиль, Лефебюр-Вели и сменивший Бенуа на посту профессора органного класса Сезар Франк.
Композиторское наследие Бенуа, наряду с широким кругом органных сочинений (в частности, 12-томной «Библиотекой органиста»), включает различную церковную музыку (в том числе Реквием, 1842), а также оперы «Леонора и Феликс» (1821), «Отелло» (1844) и др., ряд балетов, из которых наиболее известен был написанный совместно с Наполеоном Анри Ребером «Влюблённый дьявол» (фр. Le Diable amoureux; 1840).