Фрэнки родился 5 декабря 1985 года в Риджервуде, штат Нью-Джерси, США в небогатой семье. Отец — Франсиско Муниз III, ресторанный менеджер; мать — Дениз Муниз, бывшая медсестра. Имеет пуэрториканские (по отцу) и итальяно-ирландские корни (по матери). У Фрэнки есть старшая сестра Кристина. Образование Фрэнки получал дома, не посещал никаких образовательных учреждений. Занимался усиленно баскетболом, параллельно со спортом занимался музыкой, играя на ударных инструментах.
Первоначально Фрэнки играл в эпизодах сериалов или кино. В 1997 он сыграл в сериале «Танцуй с Оливией» и в фильме «Что сказал глухой человек». С 1998 года он пользовался успехом в молодёжных сериалах. Его известным ролями были Анджело в сериале «Сабрина — маленькая ведьма», Росс в фильме «Маленький человек» и Вилли Морис в фильме «Мой пес Скип».
Настоящую славу в мыльной опере он приобрёл благодаря сериалу «Малколм в центре внимания» (с 2000 года). Сериал «Малкольм в центре внимания» рассказывал об обычной жизни 15-летнего подростка, каким был Фрэнки.
Сериал растянулся на 7 сезонов, но это не помешало Фрэнки сняться в новых полнометражных фильмах. Он имел главную роль в спортивной драме «Мой пёс Скип», однако успеха ему это не принесло, как «Малколм». В этом же 2000 году он успел сняться в комедийной мелодраме «От судьбы не уйдёшь», а в 2001 году озвучивал роли медведей в известной семейной комедии «Доктор Дулиттл 2».
В 2002 году снялся в комедии «Большой толстый лжец» Шона Леви, тогда еще начинающего режиссёра. Позже Фрэнки пробует себя в криминальном боевике и снимается в фильме «Дикие бесы» 2002 года.
В этом же году он пробует себя в главной роли в боевике «Агент Коди Бэнкс». Фрэнки озвучивал персонажей мультсериала «Симпсоны», после «Коди Бэнкса» его голос стал более узнаваем.
А уже в 2004 году он озвучивал главного героя в фильме «Бешеные скачки» — зебру Полосика. В том же 2004 году Фрэнки снова снялся в роли опального шпиона Коди в фильме «Агент Коди Бэнкс 2: Пункт назначения Лондон».
Теперь его больше приглашали во взрослые фильмы и сериалы: это сериал «Мыслить как преступник» (2005—2008), фильм «Остаться в живых» (2006), мелодрама «Мой самый сексуальный год» (2007) и фильм Division III (2009).
Кроме популярности в молодёжных фильмах Фрэнки ещё популярен в автоспорте.
После игр в баскетбол у Фрэнки появляется новое хобби — вождение спортивных болидов. С 2005 года ему предложили водить болид, а 11 апреля 2006 года он стал профессионалом и начал карьеру автогонщика.
Он выиграл гонку Pro/Celebrity Race в 2005 году. Но в марте 2006 года состоялась его первая «официальная» победа: он занял 1-е место в гонках Toyota Grand Prix of Long Beach. В этих гонках он участвует до сих пор.
С марта 2006 он участвует в гонках Cold Pizza. С этого же года участвует на гонке Rasing Carts. С 2007 года принял участие в гонках Лас-Вегаса, а также в гонках Хьюстона.
В январе 2010 года поступило известие, что Фрэнки Мунис помимо игры в кино решил стать музыкантом. Он — приглашённый барабанщик в группе You Hang Up. В этом же году группа планирует выпустить альбом и устроить тур по Соединённым Штатам.
Встречался с Джэйми Гэнди из Нью-Орлеана, с которой познакомился во время съёмок фильма «Остаться в живых». Помолвку они объявили 19 июля 2005 года. Позже помолвка была расторгнута.