Фрэнсис Мэрион родился 26 февраля 1732 г. на плантации Гоутфильд в гражданского округа Сейнт Джеймс, округа Беркли , Южная Каролина. Фрэнсис Мэрион начал военную карьеру незадолго до своего 25-летия. 1 января 1757 г. Фрэнсис и его брат Джоб были рекрутированы капитаном Джоном Постеллом для участия в войне французов против индейцев с целью изгнания племени индейцев Чероки за пределы штата. В 1761 г. Мэрион служил в качестве лейтенанта под командованием капитана Уильяма Мултри в военной компании против Чероки. В 1775 г. Фрэнсис Сэрион был членом Провинциального конгресса штата Южная Каролина. 21 июня 1775 г. Мэрион был назначен капитаном во Второй полк Южной Каролины под командование Уильяма Мултри, с которым он служил в июне 1776 г. во время защиты форта Салливан и форта Мултри в Чарльстонской гавани. В сентябре 1776 г. Континентальный конгресс назначил Мэриона подполковником. Осенью 1779 г. он участвовал в осаде Саванны, а в начале 1780 г. под командованием генерала Бенджамена Линкольна был направлен на строевые учения добровольческих вооруженных отрядов.
Генерал Франсис Мэрион послужил прототипом для создания образа главного героя фильма «Патриот» — Бенджамина Мартина, которого сыграл в фильме популярный актёр Мел Гибсон. Ранее в 1959 г. был снят телесериал «Болотный лис» (The Swamp Fox), в котором главного героя — генерала Фрэнсиса Мэриона, сыграл Лесли Нильсен.