Родился 13(26) ноября 1902 года на берегу Нуры в местности под названием Сартобе, недалеко от посёлка Токаревка, Акмолинской области Российской империи (сейчас Бухар-Жырауский район Карагандинской области Казахстана) в семье кочевника.
В 1917 году окончил РТУ при Спасском медеплавильном заводе. Работал на шахтах Караганды.
В 1926 году переехал в столицу Казакской АССР Кызыл-Орду, где работал в судебных органах.
В 1930 году переезжает в строящуюся Караганду.
С 1938 года живёт в Алма-Ате. В 1940 году вступил в КПСС. С 1956 года член ЦК КП Казахстана.
С 1953 по 1956 год председатель правления Союза писателей Казахстана. С 1962 по 1964 1-й секретарь правления Союза писателей Казахстана.
Депутат Верховного Совета СССР 6-го созыва.
С 1927 года Габиден Мустафин начал издаваться. Первый сборник рассказов «Ер Шойын» вышел в 1929 году.