С 1972 года — на действительной военной службе во Внутренних войсках МВД СССР.
1976 год — окончил Новосибирское высшее военное командное училище Внутренних войск МВД СССР.
(1987 год) - окончил Военную Академию имени М.В. Фрунзе.
[[ По окончании ВА проходил службу в 42 дивизии Внутренних Войск МВД СССР(г.Вильнюс). Командовал батальоном конвойного полка г.Каунас, затем начальник штаба полка]]
С 1994 года — командир полка Внутренних войск в Дагестане. Участвовал в первой чеченской войне 1994-1996 годов.
1999 год — окончил Военную академию Генерального Штаба Вооружённых Сил Российской Федерации.
С 1999 года был командиром 21-й Софринской отдельной бригады оперативного назначения Московского округа Внутренних войск МВД России.
Под его руководством успешно проведены специальные операции в городе Гудермесе, населённых пунктах Луговое, Привольное, Червлённая, Старощедринская, Виноградное, Брагуны, Дербанхи. При проведении спецопераций в районе Гудермеса полковник Фоменко лично возглавил роту и предотвратил прорыв противника через позиции войск.
С февраля 2000 года — генерал-майор.
С 2001 года по 2007 год— начальник штаба — первый заместитель командующего войсками Северо-Западного округа Внутренних войск МВД России.