С 1856 года Мейсснер совместно с Генле издавал журнал «Bericht ?ber die Anatomie und Physiologie».
Одним из самых известных учеников Мейсснера был микробиолог Роберт Кох.
Многочисленные научные труды Мейсснера касаются преимущественно физиологии человека. Ниже приведена только небольшая часть его произведений:
В честь Георга Мейсснера названо Мейсснерово сплетение — одно из сплетений энтеральной нервной системы полых органов желудочно-кишечного тракта.