Был женат на Корнелии Младшей, дочери Луция Корнелия Цинны, сестре первой жены Юлия Цезаря.
В гражданской войне между Гаем Марием и Луцием Корнелием Суллой, Агенобарб принял сторону первого. Когда Сулла получил верховную власть в 82 до н. э., Агенгобарб попал в проскрипционные списки и сбежал в Африку, где он присоединился к таким же изгнанникам как и он. С помощью нумидийского царя Иарба он собрал армию, но был разгромлен при Утика Помпеем Великим, которого Сулла послал против него. Впоследствии Агенобарб был убит при штурме его военного лагеря в 81 до н. э. Согласно некоторым отчетам, Агенобарб был казнен после битвы по приказу Помпея.