Родился 24 июля 1945 года в г.Подольске Московской области в семье военного. В 1962 году поступил на физический факультет Ленинградского государственного университета (ЛГУ) им. А.А. Жданова, в 1963 - на Математико-механический факультет ЛГУ. Свои первые статьи Н.В. Хованов написал на третьем курсе (опубликованы в Известиях АН СССР (1967) и "Вопросах философии" (1969)). В 1968 году окончил математико-механический факультет ЛГУ по специальности "Математика" (кафедра теории вероятностей). В 1968 году поступил в аспирантуру математико-механического факультета, в 1970 году перешел в заочную аспирантуру. В 1970-1972 годах работал старшим преподавателем Калмыцкого государственного университета имени Пятидесятилетия образования Калмыцкой АССР. В 1972 году защитил диссертацию "Стохастическая модель принятия решений в условиях дефицита времени и информации" на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук (научный руководитель - В.П. Скитович) и вернулся в Ленинград . Начал работать в ЛГУ, сначала как старший инженер НИИ Вычислительной математики и процессов управления (ВМ и ПУ) ЛГУ (1972), с 1973 года - как младший научный сотрудник НИИ ВМ и ПУ ЛГУ (1973). В 1973 году начал работать на факультете прикладной математики-процессов управления ЛГУ, сначала как ассистент кафедры высшей математики факультета ПМ-ПУ, с 1977 года - доцент кафедры математической статистики, теории надежности и массового обслуживания (МСТНМО) факультета ПМ–ПУ ЛГУ. В 1991 году защитил диссертацию "Математические модели получения и обработки нечисловой информации (Теория квалиметрических шкал)" на соискание ученой степени доктора физико-математических наук (ВЦ АН СССР, Москва), в 1993 году Н.В. Хованову было присвоено ученое звание профессора. С 1991 года - профессор кафедры МСТНМО факультета ПМ–ПУ СПбГУ. В 1995 году перешел на работу на экономический факультет СПбГУ. С 1995 года до настоящего времени - профессор кафедры экономической кибернетики экономического факультета СПбГУ. Член диссертационного совета при Санкт-Петербургском НИИ информатики РАН. Является автором более 200 научных публикаций. Под научным руководством Н.В. Хованова подготовлено более 20 кандидатских и ряд докторских диссертаций.
В работах Н.В. Хованова разрабатываются модели неопределенности и риска, методы принятия решений и обработки нечисловой информации. Н.В. Ховановым разработана методология АСПИД (АСПИД - Анализ и Синтез Показателей при Информационном Дефиците), позволяющая разрабатывать различные методы анализа сложных объектов различной природы и назначения (от отдельных экземпляров продукции до сложных технических систем и вариантов принимаемых стратегических решений). Разработки, связанные с АСПИД - методологией, поддерживаются Российским фондом фундаментальных исследований: под научным руководством Н.В. Хованова был успешно выполнен проект "Разработка системы унифицированных математических и компьютерных моделей оценивания в условиях дефицита информации финансово-экономических институтов, решений и проектов" (1996-1998), а с 1999 г. он руководит проектом РФФИ "Разработка системы экономико-математических моделей оценивания риска с использованием нечисловой, неточной и неполной информации". Н.В. Хованов был научным руководителем пяти важных научно-исследовательских работ, выполненных в 1983-1994 гг. НИИ вычислительной математики и процессов управления по постановлениям Правительства СССР и РФ.
Жена - Ольга Евгеньевна, окончила исторический факультет ЛГУ, работала редактором Издательства СПбГУ. Сын Кирилл (р.1973) - окончил математико-механический факультет СПбГУ и Коннектикутский университет (США).