В 1940 году окончил Тбилисское артиллерийское училище. Во время Великой отечественной войны участвовал в боях в Крыму, Закарпатье, Чехословакии. Несколько раз был ранен, награжден орденами и медалями. В 1949 году окончил Военную академию им.Фрунзе, потом высшие артиллерийские курсы в Ленинграде. В дальнейшем служил на должностях начальника артиллерии дивизии, командира артиллерийской бригады, начальника артиллерии и ракетных войск армии и военного округа.
С началом военной фазы Карабахского конфликта приехал из Санкт-Петербурга в Нагорный Карабах. В период с 1992 по 1998 год являлся советником председателя Комитета самообороны НКР и первым заместителем командующего АО НКР. Внес значительный вклад в формирование армейских структур и служб АО НКР, особенно артиллерии, создание учебных воинских частей, центров, стрельбищ и полигонов. Руководил рядом военных операций по подавлению огневых точек противника, в частности, на прилегающих к Степанакерту территориях и Мартунинском районе НКР. За проявленное в боях мужество и смелость был награжден орденом «Боевой крест» первой степени.
Именем Христофора Иваняна назван военно-спортивный колледж при министерстве обороны НКР в Степанакерте, а также в 2000 году город Ходжалы переименован в Иванян. О его жизни снят документальный фильм.