Под его руководством защищены 20 кандидатских и 10 докторских диссертаций. Ушаков И. Б. является заведующим кафедрой авиационной и космической медицины Московской медицинской академии имени И. М. Сеченова.
Автор и соавтор более 400 научных публикаций, в том числе 8 монографий издательств «Наука» и «Медицина», 15 патентов.
Заместитель академика-секретаря Отделения профилактической медицины РАМН, член двух экспертных советов ВАК РФ, член Проблемной комиссии по физиологии экстремальных воздействий Научного совета РАН по физиологическим наукам, председатель Проблемной комиссии Межведомственного научного совета по проблеме гипоксии, заместитель главного редактора журнала «Экология человека», член редколлегии журналов «Авиакосмическая и экологическая медицина», «Технологии живых систем» и других изданий, действительный член Международной академии астронавтики.
Заслуженный врач Российской Федерации.