Получив после смерти отца так называемую Новую Мархию (Neumark), Иоанн укрепил города Кюстрин и Пейтц, сильно поднял уровень благосостояния подданных и в 1536 примкнул к Реформации и вступил в шмалькальденский союз. Во время Шмалькальденской войны он изменил своей партии и помог императору, особенно своим участием в мюльбергской битве. Интериму, впрочем, он не захотел подчиниться. В войне с Францией он помогал Карлу и принимал участие в осаде Меца. После его смерти Новая Мархия была соединена с курфюршеством.