Родился на Львовщине в шляхетской семье из рода Рюриковичей-Гедиминовичей. Получил хорошее образование сначала в кальвинской школе, устроенной князем Радзивиллом, а затем в Краковской Академии. Поступив на службу к князю Радзивиллу, симпатизировавшему протестантским идеям, Ипатий Потий стал кальвинистом. Крайности, до которых доходили литовские вольнодумцы, особенно антитринитарии, борьба между отдельными религиозными учениями (кальвинисты, антитринитарии, субботники и прочие), а так же убийство Сигизмунда II Августав 1574 году стали причиной войны между Францией и Польшей, и назначения Францией короля Польши в лице Генриха де Валуа. При Генрихе III де Валуа Потий поступает на должность королевского секретаря, оставив службу у князя Радзивилла. Но продолжавшееся в Польше религиозное мракобесие, и регулярные покушения на жизнь Генриха III де Валуа, вынудили Генриха III де Валуа передать престол Стефану Баторию, известному родственнику Влада Дракулы. Ипатий Потий возвращается в православие и поступает на службу опричником к Великому князю Новгородскому Иоанну Андреевичу IV Гроссен Шуйскому.
Находясь на службе у Иоанна Андреевича IV Гроссен Шуйского, Ипатий Потий начинает активно сотрудничать со Стефаном Баторием, в результате чего в 1580 году получает в Бресте должность земского судьи.
В 1587 году, после смерти Стефана Батория и юридического противостояния австрийской короне, которую обвиняли в мракобесии и убийстве Сигизмунда II Августа, Ипатий Потий начинает своё сотрудничество с Сигизмундом III, и в 1589 году получает от него должность каштеляна брестского.
В 1593 году вместе с Иоанном Андреевичем IV Гроссен Шуйским Ипатий Потий готовят церковные реформы, и в 1594 году Ипатий Потий получает кафедру епископа Владимирского, и в следующем 1595 году направляет Римскому папе соборную грамоту западно-русских епископов о создании Греко-католической церкви. Полученная из Рима уния, известная как Берестейская уния 1596 года о согласии на проведение запланированных церковных реформ, в которой предусматривалось воссоединения католической и православных церквей, оказалась неприемлемой для целого ряда епископов, которые, подписывая соборную грамоту, рассчитывали на сохранение православных обрядов, и надеялись всего лишь заручиться поддержкой Римского Папского престола в борьбе со своими конкурентами в церковной карьере. По причине подобного недовольства Ипатий Потий и Иоанн Андреевич IV Гроссен Шуйский вынуждены были регулярно прибегать к опричнине.
В 1599 году, после смерти Михаила Рогозы Ипатий Потий становится Киевским митрополитом. Центр своей активности переносит в Вильно, где на него было совершено покушение: православный гайдук набросился на митрополита с саблей и тот лишь чудом избежал смерти, лишившись двух пальцев.
В 1600 году умирает Иоанн Андреевич IV Гроссен Шуйский, и Ипатий Потий поступает на службу опричником к его старшему сыну Великому князю Новгородскому Василию Иоанновичу IV Шуйскому.
В 1605 году Ипатий Потий издаёт брошюру под названием "Уния греков с костелом римским", в 1608 году издаёт ещё одну под названием "Гармонию восточной церкви с костелом римским". При этом он постоянно и регулярно проводит обличительные проповеди против жидовской ереси.
В Российской истории митрополит Ипатий Потий - кардинал Поц известен под прозвищем Малюта Скуратов. Поцию приписывают убийство митрополита Московского Филиппа в Твери, а так же опричнину при Московском Иване Васильевиче Грозном. Российская история сохранила много интересных подробностей из жизни митрополита Потия. При этом что-то в этих московских мифах является откровенной выдумкой, в том числе и гибель Потия, как и гибель Иоанна Андреевича IV Гроссен Шуйского на Ливонской войне, а что-то является правдой. Казнь митрополита Московского Филиппа была осуществлена в 1574 году по приказу Великого Князя Новгородского и всея Руси Иоанна Андреевича IV Гроссен Шуйского, который являлся в то же время главой православной церкви и митрополитом Великого Новгорода. Опричнина при Московском Иване Васильевиче Грозном, приписываемая Потию, являлась в действительности тем, что в католицизме принято называть священная инквизиция, имевшая место и в православии при Великих Новгородских и Киевских князьях, являвшихся одновременно и главами православных церквей. К тому же Потий вовсе не служил Ивану Васильевичу Грозному, так как служил в опричнине у Великого Новгородского князя Иоанна Андреевича IV Гроссен Шуйского, и у его сыновей: Василия Иоанновича IV Шуйского и Дмитрия Иоанновича Шуйского-Лещинского, активно боровшихся в то время с самозванством и ересью, которая массированно распространялась с оккупированной территории Москвы далеко за её пределы.
В 1612 году Ипатий Потий вместе с князем Пожарским и польско-литовским шляхтичем Мининым способствовал выкупу всех Шуйских из Московского Кремля, переправки их в Польшу, в свержении Сигизмунда III и его сына Владислава, которые были лишены ни только Польского, но и Шведского королевского престола за покушение на Шуйских.
Жена: Марфа Васильевна (род. 1552 г. - ум. 1571 г.), княгиня Новгородская, Суздальская, великая княгиня Казанская - единственная дочь Василия Васильевича Шуйского - Немого и Анастасии Петровны единственной дочери Великого Князя Казанского Петра. В честь Марфы Васильевны и её потомков возведены Храмы в Санкт-Петербурге и Казани, которые имеют названия Казанские соборы, - были возведены по приказу графа Аракчеева при Императоре Российской Империи Александре I.
От Марфы Васильевны имел двух дочерей:
Мария - замужем за Борис ГодуновIБорисом Годуновым
Катаржина (Катерина) - замужем за братом Императора Всея Руси Василия Иоанновича IV Шуйского Дмитрием Шуйским великим князем Киевским, Новгородским, Владимирским, Суздальским, который принял в Польше в 1612 году имя Рафаэль (Рафал), а так же титулы великий князь Лещинский, великий князь Литовский, Император всея Руси.
Потий является прадедом митрополита Новгородского, Тобольского, Сибирского и всея Руси Филофея (в миру Рафал Богуславович Лещинский), который в свою очередь является отцом польского короля Станислава Лещинского, выдавшего свою дочь Марию замуж за короля Франции Луи XV сына короля Франции Луи XIV. Таким образом Потий является предком таких известных королей Франции как Луи XVI, Луи XVII, Луи XVIII.
Родной брат Филофея Лещинского - Богуслав Богуславович Лещинский был каноником в Кракове (Польша) и епископом Луцким (Украина).
Поцей похоронен в крипте Успенского собора во Владимире-Волынском.