С детства Ису Байзакова окружала творческая атмосфера, которая была создана благодаря подлинному интересу и любви к искусству его отца Байзака и матери Газизы. Талантливыми домбристами и певцами были его родственники Злиха и Рахмет. Его мать умерла, когда Исе было 9 лет, затем он воспитывался у бабушки Жанбалы — певицы и рассказчицы. Рахмет научил его играть на домбре, привил любовь к народной песне.
Обучался в аульной школе, до 1917 года батрачил, работал на сибирских копях. В 1921 году окончил рабфак, в 1922 году обучался в Казахском институте просвещения в Оренбурге. В 1931-1940 годах работал на Казахском радио, в Союзе писателей Казахстана.
Во время Великой Отечественной войны выступал как певец-агитатор, исполняя свои патриотические песни. В этот период он также плодотворно работал как композитор.
В 1919-1920 годах Иса Байзаков состязался в айтысах с акынами Багитом и Кудайбергеном, в которых одержал победу. Активно участвовал в работе драмкружка в городе Семипалатинске, в художественной самодеятельности, выступал в составе концертных бригад на крупных стройках республики. Исполнял роли главных героев в ранних пьесах М. О. Ауэзова «Енлик — Кебек» и «Байбише — токал», поставленных на сцене первого Казахского национального театра (открыт в городе Кызыл-Орда в 1926 году).
В соответствии с требованиями нового времени обновил содержание 40 народных песен, среди которых — «Заулатшы-ай» (1926), «Калка», «Смет», «Назконыр» (1927) и другие. Ряд переработанных Байзаковым текстов был записан собирателем казахского музыкального фольклора А. В. Затаевичем и переложен на ноты («Кокен», «Бике», «Жар-жар» и другие). Большинство народных песен из репертуара Байзакова вошли в оперы «Айман — Шолпан», «Ер Таргын», в опере «Кыз Жибек» использовалась известная песня «Гакку».
Песни акына создавались как в устной, так и в письменной форме. В печати песни Байзакова были впервые опубликованы в 1924 году. Являлся автором ряда эпических произведений, созданных на основе казахского фольклора — «Красавица Куралай» (каз. ), «Сказка пастуха» (каз. ), «В предгорьях Алтая» (каз. ), «Кырмызы Жанай» (каз. ), «Кавказ» (каз. ), «Акбопе» (каз. ).
Именем композитора названа улица в Алмалинском и Бостандыкском районах города Алма-Аты. Именем Исы Байзакова названа улица в городе Павлодар.