И.Шараневич учился в Бережанах, затем в университетах Львова и Вены, окончил богословский и философский факультеты.
Исидор Шараневич исследовал преимущественно историю Галицко-Волынской Руси, а также деятельность русских православных братств, был одним из пионеров археологии в Галиции. Открыл высоцкую археологическую культуру. Единственный мирянин, который принимал участие во Львовском Синоде 1891 года.
Исидор Шараневич был одним из основателей Национального музея во Львове, заложил основу его фондов. В целом внёс значительный вклад в развитие истории, археологии и музейного дела в Галиции. Был учителем географа Степана Рудницкого, деятеля украинофильского лагеря.
Исидор Шараневич писал на русском, польском, немецком и латинском языках.
Под его руководством издан в 1886 году также первый том фундаментального юбилейного издания в честь 300-летнего юбилея Львовского Ставропигийского братства.