Родился 10 (23) марта 1916 года на хуторе Северо-Кубанский ныне Тбилисского района Краснодарского края. Русский.
В Красной Армии и на фронте с августа 1941 года. После окончания Великой Отечественной войны, участвовал в Советско-японской войне 1945 года.
Командир отделения 132-го моторизованного штурмового инженерно-сапёрного батальона (15-я армия, 2-й Дальневосточный фронт) комсомолец старший сержант Иван Якубин 13 августа 1945 года участвовал в блокировке штурмовой группой одного из крупнейших японских дотов Фуцзиньского укреплённого района.
Мужественный воин, спасая жизнь офицера, погиб в неравном рукопашном бою.
Похоронен в городе Фуцзинь (Китайская Народная Республика).
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 8 сентября 1945 года за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с японскими милитаристами и проявленные при этом мужество и героизм старший сержанту Якубину Ивану Максимовичу посмертно присвоено звание Героя Советского Союза.
Награждён орденом Ленина, медалями.