В 1974 году окончил Ленинградский инженерно-строительный институт по специальности «архитектор». Возглавлял Государственную инспекцию по охране памятников Санкт-Петербурга. С 1987 года до последнего дня Саутов работал директором Государственного музея-заповедника «Царское Село».
В 1997 году «за заслуги в области реставрации и музейной деятельности» Указом Президента РФ Иван Петрович Саутов был награжден Орденом Дружбы. Лауреат Государственной премии России — за участие в реставрации Большого Кремлёвского дворца, все деньги от премии перечислил на реставрацию православного храма.
Снимался в роли генерала Рузского в фильме «Романовы. Венценосная семья», а также помогал в съёмке фильма Александра Сокурова «Русский ковчег» про Эрмитаж.
Умер 1 августа 2008 года в Финляндии, где отдыхал с семьёй. Причиной смерти стал сердечный приступ. Похоронен на Литераторских мостках.