Родился 26 октября 1924 года в городе Черкассы в семье рабочего. Еврей. Окончил девять классов средней школы. Работал слесарем на машиностроительном заводе.
В 1942 году призван в ряды Красной Армии Самаркандским райвоенкоматом. В 1943 году окончил Ташкентское пулемётное училище. В боях Великой Отечественной войны с сентября 1943 года. Воевал на Северо-Кавказском фронте.
2 ноября 1943 года 6-й гвардейский стрелковый полк готовился к высадке на берег Керченского полуострова, занятого противником. При высадке десанта гвардии младший лейтенант И. С. Якубовский получил приказ. Его взвод противотанковых ружей и два взвода автоматчиков должны подавить огневые точки врага.
Сильный огонь артиллерии и миномётов не остановил десантников, группа высадилась на берег и захватила плацдарм в районе посёлка Жуковка. В течение всей ночи шел бой за удержание плацдарма. А утром противник сильным огнём остановил продвижение десантников. Едва только кончился обстрел, как гитлеровцы пошли в полный рост на редкие цепи десантников. Но воины не дрогнули и отбили атаку.
Немцы снова пошли в «психическую атаку», которая также как и третья была отбита. А когда немцы пошли в четвертую атаку, бойцы, измученные бессонной ночью и многочасовым боем, начали отходить. Это означало для всех — конец. Тогда поднялся И. С. Якубовский: «Гвардейцы! За Родину! Вперёд!» и с пистолетом в руке пошёл навстречу наступающей цепи. Пример командира ободрил бойцов, они поднялись и пошли за ним. Положение было восстановлено, атака отбита.
10 апреля 1944 года Израиль Семёнович Якубовский погиб в бою под деревней Смолицы Быховского района Могилёвской области, где и похоронен.