Родился в Тарнуве, но прожил там всего до двух лет. Потом вместе с отцом (он тоже был футболистом) переехал в Гжешув, где его семья живёт и поныне. Там, в возрасте десяти лет, пошёл в футбольную школу. В Польше играл за команды первого дивизиона.
В 2001 году перешёл в «Карпаты». Мацей сразу завоевал место в стартовом составе. В 2005 году перешёл в латвийскую «Ветру», но через некоторое время у команды возникли финансовые трудности, и Налепа вернулся в «Карпаты». С 2008 года играет за ФК «Харьков».
Провёл два матча за сборную Польши.