В ВМФ с 1940 года. Член партии с 1942-го. Окончил Высшую партийную школу при ЦК КПСС (1951). Участник Великой Отечественной войны с июня 1941-го на Северном флоте. В период советско-японской войны в августе 1945-го высаживался с десантами в порты Юки (Унги), Расин (Расон), Сейсин (Чхонджин). Командир взвода отдельного разведывательного отряда особого назначения Тихоокеанского флота, главный старшина. 13 августа 1945 года со своими бойцами первым высадился в порту Сейсин (ныне — Чхонджин), прорвавшись в тыл противника. Десантники захватили мост, отрезав противнику пути отхода; Бабиков был ранен, но не оставил поле боя, за что позднее ему было присвоено звание Героя Советского Союза.
С 1946 года в запасе. На советской и комсомольской работе, служил в органах госбезопасности. Скончался Макар Андреевич Бабиков 2 февраля 2009 года.