Первые изображения Макетатон были на стенах храма ее матери Нефертити Хут-бенбен, где она и ее старшая сестра Меритатон появляются рядом с королевой. Она также была изображена на пограничной стеле указывающей пределы Ахетатона новой столицы фараона Эхнатона. Макетатон переехала туда с семьей, когда была еще маленьким ребенком.
Макетатон умерла в 13 или 14 год царствования своего отца. В 12 год она была еще жива, поскольку была изображена с родителями и сестрами на приеме иностранной дани — церемонии, которую можно увидеть на некоторых изображениях в гробницах высокопоставленных чиновников, таких, как амарнского интенданта Хуйя и верховный жрец Мерир II .
Тот факт, что на осколках ее саркофага мы видим такие картуши как Аменхотеп III и Эхнатон можно истолковать как доказательство длительного соправления двух фараонов, отца и сына.
Весьма вероятно, что эпидемия чумы, охватившая Египет между 12-м и 15-е годы царствования Эхнатона, и привела к тому многие члены королевской семьи перестают упоминаться, среди них королевы-мать Тейе, королева Нефертити, средняя жена Эхнатона Кийа, Макетатон и две молодые принцессы Нефернеферура и Сетепенра. Впрочем, смерть Макетатон могла произойти и не из-за чума, а — в соответствии с широко распространенной теорией — от рождения ребенка.
Была похоронена в гробнице Эхнатона, тело не найдено.
На стене усыпальницы, приготовленной в скалах для царской семьи, изображено отчаяние супругов на ложе распростерта мертвая девочка. Рядом замерли родители — отец с заломленной над головой рукой, а другой рукой схвативший за руку жену, и мать, прижавшая руку к лицу, словно еще не верящая своей утрате. Пожилая нянька умершей рвется к телу любимицы, ее удерживает молодая служанка. Сцена смерти Макетатон по силе переданных чувств, бесспорно, относится к шедеврам египетского рельефа.