Родился в 1782 г.; образование получил в 2-м кадетском корпусе, курс которого окончил в 1798 г. и поступил на службу в чине подпоручика в 5-й артиллерийский батальон. Значительная часть служебной деятельности Таубе прошла в походах и боях.
Он принимал участие в Турецкой войне 1807 и 1811 гг., находясь при взятии Бухареста, в сражениях под Журжею, при взятии Силистрии, при блокаде Шумлы и штурме Рущука, причём за дело при Силистрии награждён был золотой шпагой с надписью «За храбрость».
В 1812 г. за участие в Отечественной войне Таубе получил чин подполковника. В Заграничных походах против французов 1813—1814 г. он сражался под Лейпцигом и 7 октября 1813 г. получил орден св. Георгия 4-й степени
Затем участвовал в занятии Гамбурга, в сражениях при Краоне и Лаоне, где пожалован был алмазными знаками ордена св. Анны 2-й степени, а также при взятии Парижа.
В эту же кампанию Таубе за отличие произведён был в полковники. По окончании военных действий командирован был за границу в 1817 г. в отдельный корпус графа Воронцова в качестве исправляющего должность окружного начальника по артиллерийской части в крепостях, временно занятых русскими войсками.
17 декабря 1819 г. его назначили командиром Тамбовского пехотного полка, 17 апреля 1822 г. с производством в генерал-майоры — на должность начальника сначала 1-й бригады 15-й пехотной дивизии, а затем 3-й бригады 3-й пехотной дивизии.
С 1825 по 1831 г. Таубе служил на Кавказе при войсках отдельного Кавказского корпуса. Здесь он участвовал в экспедиции, предпринятой в 1831 г. в Чечню, и в подавлении восстания койсубулинцев в Дагестане. В 1830 году часть русских войск в связи с польскими событиями в срочном порядке стали перебрасывать на новый театр военных действий. 10 мая покидает Тифлис Паскевич и так же отбывает в царство Польское. Вместо себя он оставляет генерала Эмануэля командовать кавказской линией и генерала Панкратьева в Закавказье. Русские войска получили приказ воздерживаться от наступательных операций. В этот момент глава горцев имам Гази Магомед, почувствовав слабость противника, решает перехватить инициативу. 16 мая имам переходит на новые позиции у Алти-Буюна. Генерал Таубе попытался было 20 мая воспрепятствовать перехватить горцев, но безуспешно, и вынужден был отойти, полностью оголив левый фланг кавказской линии. На подмогу Таубе был направлен отряд Каханова. Русские войска пытались безуспешно поймать Гази Магомеда и навязать ему генеральное сражение, имам же от погони уходил, нанося удары в самых неожиданных местах и , показывая всему Кавказу беспомощность русской армии.
В 1832 г. М.М. Таубе назначен председателем Кавказского областного управления, а в 1835 г. — Кавказским гражданским губернатором; в 1836 г. произведён был в генерал-лейтенанты и в 1839 г. назначен сенатором. Умер 25 июля 1849 г.