Окончил МФТИ по специальности «инженер-физик» в 1982, кандидат экономических наук. В 1985—1992 — научный сотрудник, начальник отдела ИМЭМО, проходил стажировку в Национальном бюро экономических исследований США.
Советник, затем главный экономический советник в группе консультантов Государственного комитета РФ по управлению государственным имуществом в 1992 — 1995.
Заместитель председателя — ответственный секретарь Комиссии Правительства РФ по экономической реформе в 1995. Генеральный директор Российского центра приватизации в 1993 — 1996.
Заместитель руководителя Администрации Президента РФ в 1996 — 1997. Отвечал за взаимодействие с политическими партиями, общественными организациями, вопросы средств массовой информации. Одновременно являлся также председателем Совета по делам инвалидов при Президенте РФ. Был членом Временной чрезвычайной комиссии при Президенте РФ по укреплению налоговой и бюджетной дисциплины. Член Совета директоров ЗАО «Общественное российское телевидение» в 1996 — 1997, председатель Коллегии представителей государства в ЗАО ОРТ в 1997.
Заместитель председателя Правительства РФ — председатель Государственного комитета по управлению государственным имуществом в августе — октябре 1997. В октябре 1997 Государственный комитет был преобразован в Министерство государственного имущества, и Бойко занял пост Заместителя председателя Правительства РФ — Министра государственного имущества, однако в ноябре 1997 в связи со скандалом вокруг гонораров за книгу «История приватизации в России» ( «Дело писателей» ), вынужден был подать в отставку.
Правнук Алексея Лозовского. Отец Бойко носит фамилию Шамберг.