Мамедтаги Ганиев является автором более, чем 200 научных трудов, был руководителем более 50 кандидатов и докторов наук. Автор учебников «Общая микробиология» (1933), «Ветеринарная микробиология» (1948).
Был награжден медалями «За оборону Кавказа», «За отважный труд» во время Великой Отечественной Войне.
За заслуги в научно-педагогической области был награжден Почетной Грамотой Верховного Совета Азербайджанской Республики, двумя Орденами «Знак Почета» и Орденом «Трудового Красного Знамени», золотыми и серебряными медалями Всесоюзной Выставки Достижений Народного Хозяйства.