Мануэл ди Оливейра Гомиш да Кошта родился 14 января 1863 года в столице Королевства Португалии Лиссабоне в семье младшего офицера (лейтенанта)крестьянского происхождения Карлуша Диаша да Кошты (род. 1833 г.) и его жены Мадалены ди Оливейры. У него были две младшие сестры Лукреция и Амалия. Всё детство Гомиш да Кошта провёл в отдалённых португальских колониях, где проходил службу его отец — на острове Восточный Тимор в водах Голландской Индии (ныне Индонезия), и в Макао, на побережье Китая. Он получил начальное образование в семинарии Святого Иосифа в Макао и в 1873 году, по достижении 10 лет, был отдан на обучение в Военный колледж.
8 ноября 1880 года, по окончании Военного колледжа, Гомиш да Кошта добровольно вступил солдатом в 4-ю артиллерийскую роту и был принят на пехотные курсы Общевойскового училища (Военной школы), которое окончил в 1884 году, получив там звание сержанта 1-го класса и кандидата в аспиранты. Он был зачислен во 2-й батальон королевских стрелков и 9 января 1884 года получил звание алферса по должности. Гомиш да Кошта первоначально служил в 11-м пехотном полку, с 1 сентября 1884 года — в 1-м пехотном полку, с 31 января 1885 года снова в 11-м пехотном полку и в декабре 1885 года ему было присвоено звание алферса. 24 декабря 1885 года Гомиша да Кошту перевели в 24-й пехотный полк, где он с 3 февраля по июнь 1886 года прослужил адъютантом, а 4 сентября того же года направили в 23-й пехотный полк.
В 1887 — 1889 годах Гомиш да Кошта служил в финансовой гвардии (порт. Guarda Fiscal): С 26 ноября 1887 года в 1-м батальоне, где 7 ноября 1889 года получил звание лейтенанта пехоты, а затем, после короткого перевода в 13-й пехотный полк, во 2-м батальоне финансовой гвардии в качестве начальника поста в Эрисейре.
9 июня 1893 года лейтенант Гомиш да Кошта оставил службу в финансовой гвардии и 20 июня отправился на службу в Индийские колонии как адъютант генерал-губернатора Португальской Индии. В июле 1893 года ему было присвоено звание капитана колониальных войск. Отплыв из Лиссабона 6 августа капитан да Кошта 13 сентября прибыл к индийскому берегу, где ему предстояли прослужить почти три года. Он отличился военных операциях против индийских повстанцев и был назначен по совместительству администратором муниципалитета Гоа В 1895 году Гомиш да Кошта, который так же исполнял обязанности директора школу искусств и ремёсел, занял должность заместителя начальника штаба Главного командования операциями против повстанцев в португальских колониях в Индии и участвовал в бое при Гутуку. 19 марта 1895 года Гомиш да Кошта покинул Гоа и ненадолго вернулся в Лиссабон, но уже в сентябре отплыл в Мозамбик, где также отличился в завоевательных походах против империи Газа и подавлении сопротивления местных племён под руководством императора Нгунгиньяны, который был захвачен в плен. Продолжил служить в Мозамбике под командованием назначенного губернатором руководителя военных кампаний Жоакима Аугусту Моузинью ди Албукерке. В 1896 году Мануэл Гомиш да Кошта был назначен начальником штаба португальских вооружённых сил в Мозамбике. Он отличился в сражении у Маконтене 21 июля 1897 года. 20 января 1898 года Гомиш да Кошта получил звание капитана португальской армии. 23 марта 1898 года он был назначен командующим войсками и военной полицией мозамбикской провинции Газа (до 6 октября 1898 года), 2 июня 1899 года был направлен в провинцию Ньяса, где с 10 октября по 30 декабря 1899 года командовал оперативной колонной. 20 марта 1900 года Гомиш да Кошта был отозван в распоряжение Генерального штаба, в январе 1902 года получил назначение в 1-й стрелковый батальон и 3 февраля вновь был отправлен в короткую «комиссию» в Мозамбик. 25 мая 1903 года его комиссия закончилась и да Кошта короткое время служил в 16-м пехотном полку, пока в начале 1904 года его не отправили служить в Анголу. 16 февраля 1904 года он прибыл в Луанду, с 30 апреля занимал пост военного коменданта Уамбо, был начальником штаба оперативной колонны, действовавшей против народности овамбо. 5 июня 1905 года Гомиш да Кошта вернулся в Лиссабон и в сентябре получил назначение в 21-й пехотный полк. В декабре его перевели в 1-й королевский пехотный полк, а в мае 1906 года — во 2-й пехотный полк.
1 августа 1906 года Гомиш да Кошта в третий раз отплыл в Мозамбик, куда прибыл 27 августа, и 30 сентября был назначен командиром военного поста в районе Моссурул провинции Нампула. 31 августа 1907 года он был отозван в Португалию, но уже в феврале 1908 года, был в четвёртый раз направлен в Мозамбик, где 30 июня был назначен инспектором по вопросам туземного населения и подавлял сопротивление африканских племён в южных провинциях колонии. 29 января 1909 года да Коште было присвоено звание майора пехоты. Дослужившись до поста начальника кабинета генерал-губернатора Мозамбика, майор да Кошта 15 января за критику своего начальства переводится в Анголу, и 28 января 1912 года прибывает в Луанду, где 25 февраля назначается начальником штаба войск колонии. Но уже 18 июня генерал-губернатор Анголы генерал Ж.Нортон ди Матуш снимает его с этого поста. 27 июня да Кошту переводят инспектором на острова Кабо-Верде и 29 июня присваивают звание подполковника. 23 мая 1914 года на его отправляют начальником военной полиции на остров Сан-Томе, 20 июня присваивают звание полковника и 8 августа назначают начальником штаба колониальных войск провинции.
30 декабря 1914 года полковник Гомиш да Кошта вернулся в Лиссабон и 17 февраля 1915 года принял командование 1-м пехотным полком, а 15 марта — 16-м пехотным полком. С 20 августа 1915 года по июнь 1916 года он инспектирует воинские части в Мозамбике, а 30 сентября 1916 года направляется в 10-й пехотный полк.
30 января 1917 года, после того как Португалия вступила в Первую мировую войну на стороне Антанты, полковник Гомиш да Кошта был назначен командиром 1-й бригады формировавшегося в Танкуше португальского экспедиционного корпуса (порт. Corpo Expedicion?rio Portugu?s, CEP) под командованием генерала Жозе Нортона ди Матуша. Корпус был переброшен во Францию, к линии фронта во Фландрии. 7 мая 1918 года Гомиш да Кошта был произведён в генералы по должности и награждён Орденом Башни и Меча. В этот период началось приобщение да Кошты к большой политике: в декабре 1917 года он вступил в Центристскую республиканскую партию Антониу Эгаша Мониша и 1 января 1918 года был принят президентом республики Сидониу Паишем, пришедшим к власти за три недели до этого в результате военного переворота. После этого Гомиш да Кошта был назначен командиром 2-й дивизии экспедиционного корпуса и 9 апреля 1918 года командовал войскам в ходе неудачного для португальцев сражения на реке Лисе. Несмотря на то, что португальские войска не смогли удержать позиции и понесли большие потери в ходе германского наступления, Гомиш да Кошта 8 мая 1918 года получил звание генерала по выслуге лет, а затем был награждён степенью Кавалера военного Ордена Башни и Меча и Военным крестом 1-го класса. 20 июня он сдал командование дивизией и был отозван в Португалию, а 22 июля заявил, что поражение на Лисе не заслоняет подвигов португальского солдата и является наиболее заметным военным достижением португальцев за последние 50 лет.
Не смотря на то, что военная кампания во Фландрии не принесла громких побед, она, вопреки всему, заметно подняла престиж Мануэла Гомиша да Кошты.
Когда 5 октября 1910 года в Португалии произошла революция, свергшая монархию и установившая Первую республику, майор Мануэл Гомиш да Кошта находился в Мозамбике, где усмирял местные племена. В последующие годы Гомиш да Кошта не испытывал никаких симпатий к республиканскому режиму и открыто заявлял, что если бы он командовал правительственными войсками 5 октября 1910 года, то история Португалии была бы иной. Однако его, как и многих других видных военных, не уволили в отставку, оставили на должности в армии и продвигали по службе.
После возвращения в Португалию, в ноябре 1918 года генерала Гомиша да Кошту направили командующим военной экспедицией в Мозамбик, 28 июля 1919 года вновь отозвали в метрополию, назначив на должность председателя экзаменационного жюри по производству в майоры офицеров колониальных войск, а 14 мая 1921 года Гомиш да Кошта был назначен командиром 4-й дивизии в Эворе. Он всё активнее приобщался к политике, примкнув в 1920 году к объединившему монархистов и правых республиканцев движению Национальный крестовый поход Нуну Алвариша, а в 1921 году безуспешно баллотировался в парламент от Партии реформ. Генерал резко критиковал республиканский режим и правительство Демократической партии, публикуя статьи в изданиях «Seara Nova», «Opini?o», «Jornal da Madeira» и других. 26 ноября 1921 года Гомиш да Кошта был снят с должности командира дивизии и отсидел 20 дней в тюрьме за критику военного министра. В июне 1922 года он возглавлял комиссию по сбору средств на знак Орденов Башни и Меча авиаторам Карлушу Гагу Коутинью и Артуру ди Сакадура Кабралу. Правительство, устав от политических заявлений и заговорщицкой деятельности генерала, 27 сентября 1922 года направило его в качестве военного инспектора в Макао (до 27 сентября 1923 года) и Португальскую Индию (20 октября 1923 года — 17 апреля 1924 года. Вернувшись в мае 1924 года в Португалию, он активно включился в политику и поддержал Республиканскую радикальную партию Кунья Леала, находившуюся в оппозиции режиму Демократической партии. Генерал да Кошта занимал второстепенные должности, входя в состав наградной комиссии по изучению апелляций относительно наград в период Первой мировой войны и комиссии по рассмотрению проблем низовых подразделений колониальной армии. В 1925 году он был назначен председателем Комиссии по рассмотрению прошений капитанов колониальных войск, претендующих на звание майора.
Тем временем экономическое положение Португалии ухудшалось, росли инфляция и внешний долг. Кризис усугублялся политической нестабильностью, частой сменой правительств и доминированием в условиях парламентской системы Демократической партии. 26 мая 1926 года Мануэл Гомиш да Кошта установил связь с заговорщиками, планировавшими свержение режима Демократической партии. Так как тяжело заболел готовившийся в лидеры вооружённого выступления генерал Жозе Аугусту Алвиш Рокадаш, Гомиш да Кошта по предложению генерала Жоау Синела ди Кордиша согласился возглавить движение.
28 мая 1926 года в городе Брага на севере страны генерал Мануэл Гомиш да Кошта, опираясь на командиров местного гарнизона, провозгласил начало «Национальной революции» («Revolu??o Nacional»). Он издал прокламацию с призывом восстать против «невыносимого положения страны» и «отжившей свой век парламентской системы» и выступил в направлении столицы. Его призыв нашёл отклик по всей стране, но в Лиссабоне власть уже захватили республиканцы во главе с капитаном флота Жозе Мендишем Кабесадашем. 31 мая в Порту Гомиш да Кошта заявил, что правительство Мендиша Кабесадаша более не пользуется доверием вооружённых сил и отдал армии приказ идти на Лиссабон. Он получил поддержку большинства воинских частей страны, генерал Антониу Ошкар Кармона двинул на столицу из Эворы 4-ю дивизию. 1 июня в Коимбре прошла первая встреча разных фракций движения, свергшего режим Демократической партии. Там под давлением консервативной военной группировки Синела ди Кордиша был сформирован правящий триумвират в составе капитана Жозе Мендиша Кабесадаша, генерала Гомиша да Кошты и Гама Очоа. Однако Гомиш стал настаивать на замене Очоа Кармоной. 3 июня произошла вторая встреча («Конференция в Сакавене») под Лиссабоном и был сформирован второй триумвират: Мендиш Кабесадаш, Гомиш да Кошта и Ошкар Кармона. В тот же день он был назначен военным министром и министром колоний. 6 июня Мануэл Гомиш да Кошта верхом на коне триумфально вступил в Лиссабон во главе 15 000 военных и своих сторонников их всех частей Португалии. Но Мендишу Кабесадошу ещё оставались верны силы в Траз-уж-Монтиш и в Алгарве.
14 июня 1926 года Гомиш да Кошта представил в Совет министров Португалии свою программу радикальных преобразований и нового устройства португальского общества. Она предусматривала восстановление общественного порядка («ordem p?blica»), расширение полномочий президента, административную децентрализацию, корпоративную организацию экономики и её защиту от иностранной конкуренции, сильную государственную поддержку национального предпринимательства (национального труда — «trabalho nacional»), пересмотр семейного права, восстановление роли религии и реформу школьного образования. Часть идей были подсказаны ему сторонниками т. н. «лузитанского интегрализма» и впоследствии легли в основу «Нового государства», однако в тот день программа была отвергнута.
17 июня 1926 года Гомиш да Кошта отдал из Сакавена приказ армии выступить против Мениша Кабесадаша и предъявил ему ультиматум с требованием уйти в отставку. Мендиш Кабесадаш был вынужден согласиться, и его отставка была официально оформлена 19 июня. 17 июня провозглашенный президентом Мануэл Гомиш да Кошта как глава кабинета сформировал новое правительство, в котором первые дни временно замещал несколько министерских постов.
21 июня по инициативе Ролана Прету начала выходить газета «Национальная революция», а на следующий день, 22 июня была явочным порядком введена цензура печати. С 24 июня все издания в стране начали выходить с пометкой «Этот номер просмотрен Комиссией по цензуре». 29 июня декретом № 11.789 генерал Гомиш да Кошта был утверждён президентом Португалии по уполномочию правительства, а не как избранный президент. 5 июля декретом № 11.839 была узаконена уже введённая цензура печати. Она сохранялась в Португалии 48 лет и была отменена в 1974 году, в первый день «Революции гвоздик».
Однако у Гомиша да Кошты нашёлся более серьёзный соперник, чем Мендиш Кабесадаш, и правление генерала оказалос