В трёхлетнем возрасте потеряла мать, вместе с сестрой Маделин воспитывалась в сиротском приюте в Бурже. Работала на ферме. Приехав в Париж в 1881, зарабатывала на жизнь шитьем. Жила в бедности и хваталась за любую работу. В 1883 году она родила мертвого ребёнка; трудная беременность и тяжелый труд сделали её бездетной. Оду считала своим духовным сыном писателя Алена-Фурнье. Получила поддержку Октава Мирбо. Дружила с Ш.-Л. Филиппом, Л.-П. Фаргом.
Получила премию Фемина за роман «Мари-Клер» (1910). В 1997-м во Франции учреждена премия Маргариты Оду. В г. Обиньи-сюр-Нер (Шер) открыт музей писательницы. C 2007 года её имя носит библиотека в 3-м округе Парижа.