Мария Ци Юй родилась в 1885 году в Дацзи, провинция Хэбэй. В раннем детстве она потеряла своих родителей и поэтому воспитывалась в детском доме, основанном католическими священниками в деревне Ваньла. Во время Ихэтуаньского восстания 1899—1900 гг. в Китае христиане подвергались жестоким гонениям. 24 июня 1900 года повстанцы захватили деревню Ваньла, сожгли католическую церковь и убили всех католиков, которые не успели скрыться. Они оставили в живых детей сиротского приюта, среди которых была Мария Ци Юй, Люция Ван Чэн, Мария Фань Кунь и Мария Чжэн Сюй. Взяв их с собой, повстанцы доставили девочек в деревню Ваньла, где от них потребовали отказаться от христианской веры. Девочки остались верны своей вере, за что были убиты повстанцами 28 июня 1900 года.
Мария Ци Юй была беатифицирована 17 апреля 1955 года Римским Папой Пием XII и канонизирована 1 октября 2000 года Римским Папой Иоанном Павлом II вместе с группой 120 китайских мучеников.
День памяти в Католической Церкви — 9 июля.