Сарате дебютировал 21 апреля 2004 года за клуб «Велес Сарсфилд» в матче против «Арсенала» (Саранди). В 2006 году он стал лучшим бомбардиром Апертуры с 12 голами, разделив первое место с форвардом Родриго Паласио. 18 июня 2007 перешёл в клуб из Катара «Аль-Садд» и за первый сезон забил 4 гола в 6 играх, а затем перешёл в «Бирмингем Сити» на правах аренды. За один сезон, проведённый в Англии, Сарате забил 4 гола в 14 проведённых матчах. 5 июля 2008 перешёл в итальянский клуб «Лацио», также на правах аренды. В 2009 римский клуб выкупил права на аргентинца. Общая сумма сделки составила порядка 13 миллионов фунтов. В период выступлений за «Лацио» считался одним из лидеров римской команды.
В сентябре 2010 года Сарате заинтересовались московский «Спартак» и английский «Тоттенхэм Хотспур».
В января 2011 года, появились первые слухи о возможном переходе Мауро в петербургский «Зенит». Так же интерес к игроку проявил английский «Ливерпуль».
В марте 2011 года, появились слухи о переходе Сарате в московский «Спартак». В июле 2011 года появились слухи о переходе Сарате в махачкалинский «Анжи».. В августе того же года «Лацио» стал рассматривать возможность продажи футболиста, который отказался участвовать в матче еврокубков за римлян из-за того, что главный тренер клуба, Эдоардо Рейя, сказал Мауро на первой тренировке, что его в стартовом составе не будет.
31 августа 2011 года игрок перешёл миланский «Интернационале» на правах годичной аренды с возможным правом выкупа. Личный контракт подписан до 30 июня 2015 года.
В 2007 году Сарате помог сборной Аргентины (до 20 лет) выиграть Чемпионат мира среди молодёжных команд, забив в финале победный гол в матче против чешской сборной. В 2008 году главный тренер сборной Аргентины Диего Марадона вызвал Мауро в состав сборной, однако пока за команду Сарате не играл.
Женат на Натали, под новогоднюю ночь у них родилась дочь, которую они назвали Миа.
Мауро является самым младшим из пяти братьев. Три его родных брата тоже футболисты. Самый старший — Нестор к футболу отношения не имеет. Серхио завершил карьеру в 2003 году. Ариэль выступает в клубе примеры Б аргентинского чемпионата Алл Бойз. Роландо — игрок Велес Сарсфилд.