Родился в Испании. Эмигрировал в начале 1960-х годов в Данфермлайн. До Nazateth он играл в различных группах, включая Redhawks и Mark V. В 1968 году присоединился к Питу Эгнью, Дэну Маккаферти и Дарреллу Свиту, которые играли в группе Shadettes. Вскоре название группы меняется на Nazareth.
Чарльтон сыграл огромную роль в мировом успехе группы. В Nazareth он был одним из основных авторов песен, а также продюсировал многие альбомы в 1970-х годах, включая Hair Of The Dog и No Mean City.
Мэнни покинул Nazareth в 1990 году, чтобы заняться продюсерской деятельностью и собственными проектами. Он обосновался в штате Техас и создал собственную группу The Manny Charlton Band (M.C.B). С новой группой Мэнни выпустил два альбома — Stonkin и Klone This. В 2003 году группа распадается. Чарлтон также выпустил два сольных альбома Drool и Bravado.
В начале 2006 года вошёл в состав шведской рок-группы From Behind, куда также входил экс-фронтмен Samson Ники Мур. Группа выпустила свой дебютный альбом «Game Over», а также гастролировали в поддержку альбома в Европе. В 2007 году Чарлтон покинул группу.
В начале апреля выходит его сольный альбом «Americana Deluxe», содержащий кавер-версии классических песен, таких как «Sea of love» и «Tusk» (Fleetwood Mac).
В 2008 году Чарлтон отправился в гастрольный тур по США и Европе и назвал свою группу "«Nazareth featuring Manny Charlton», куда вошли ещё три американский музыканта.