Эдди настаивала на том, что человек может исцелить себя сам (правильным направлением мысли, например), управлять своей жизнью, а наслаждаться может не только физическими, но и духовно. Она называла такое исцеление — христианскими методами лечения. Мэри Бэйкер Эдди утверждала, что за описываемыми в Библии чудесами, совершаемыми Иисусом, есть вполне объяснимые факты. Официальные религиозные конфессии считают движение Христианской Науки псевдохристианской сектой.
Мэри Морс Бэйкер родилась в городе Боу, штат Нью-Гэмпшир. Она была младшей из шести детей в семье Абигаль и Марка Бэйкер. Семья Мэри исповедовала Конгрегационализм, но сама Мэри не принимала такие понятия, как предопределение и первородный грех. С раннего детства она страдала набором хронических заболеваний, и увлеклась библейскими писаниями, особенно её привлекали упоминания о божественных исцелениях.
10 сентября 1843 года Мэри вышла замуж за Джорджа Вашингтона Гловера, состоявшего в масонском братстве в степени магистра (англ. Royal Arch Mason). Но уже в следующем году её муж умер от лихорадки, не дожив двух месяцев до рождения их сына.
В 1853 году вышла замуж за дантиста Дэниэла Паттерсона. Его мать плохо приняла её и её сына от первого брака, а муж стал изменять вскоре после свадьбы. Он влез в долги и заложил имущество Мэри, её украшения, мебель и книги. Это, однако, не спасло ситуацию; они разорились и были вынуждены съехать из своего дома в Гротоне. Мэри переехала в дом своей сестры.
В 1873 году Мэри Бэйкер Эдди разводится с Паттерсоном, обвинив его в измене. В 1877 году она снова выходит замуж. Её мужем становится Аза Гилберт Эдди (англ. Asa Gilbert Eddy), который скончается в 1882 году.
Марк Твен опубликовал в 1903 году сатирический опус, где раскритиковал Мэри Бэйкер Эдди и её «Христианскую науку». Книга так и называлась — «Христианская наука» (англ. Christian Science).
Мэри Бэйкер Эдди умерла 3 декабря 1910 года в своём доме (400 Beacon Street, Chestnut Hill, Newton, Massachusetts) в Ньютоне. Она была похоронена 8 декабря 1910 года на кладбище Mount Auburn Cemetery в Кембридже (Массачусетс).