Олимпийский чемпион-1996 и чемпион мира-1995 в индивидуальной гонке с раздельным стартом.
В 1994 году установил мировой рекорд в часовой гонке на треке — 53 км 40 м.
Выносливость и физические данные (рост 188 см и вес 80 кг) дали ему прозвища «Мигелон» (Miguel?n) и «Большой Миг» (Big Mig).
Индивидуальные физиологические особенности Индурайна уникальны не только по сравнению с обычными людьми, но и по сравнению со спортсменами — объём лёгких около 8 литров (при среднем показателе 6 литров), кровообращение позволяло прокачивать по организму до 7 литров крови в минуту (у обычных людей в среднем 3-4 л, у велогонщиков 5-6 л), пульс в состоянии покоя — 28 ударов в минуту (средний показатель у людей — 60-70 ударов).
Обладатель многих спортивных и государственных наград, среди которых можно выделить испанский Орден Большого Креста за заслуги в спорте, Премию Принца Астурийского, французский Орден Почётного легиона.