С 5 марта 2004 года по 12 сентября 2007 года — Председатель Правительства России (с формальным перерывом с 7 по 12 мая 2004 года, когда, согласно Конституции, его правительство сложило полномочия перед переизбранным на второй срок Президентом, но уже через пять дней было повторно утверждено Государственной Думой). 12-14 сентября 2007 года исполнял обязанности Председателя Правительства до формирования нового состава Правительства во главе с Виктором Алексеевичем Зубковым.
Кандидат экономических наук (тема диссертации: «Современные тенденции международных экономических отношений и внешнеэкономические связи России»). Владеет английским и испанским языками.
Классный чин гражданской службы — «Действительный государственный советник Российской Федерации I класса» (2000). Воинское звание — полковник запаса.
Родился в селе Курумоч Красноярского района Куйбышевской области.
Обучался в гимназии № 710 РАО. Воспоминания учителя физкультуры Н. Л. Берсудского :"Он активно участвовал во всех школьных соревнованиях, ходил в школьную секцию по волейболу и входил в сборную школы, выступал на всех районных соревнованиях."
в 1972 — Окончил с красным дипломом МГТУ «Станкин» по специальности «инженер-механик». Во время учёбы вступил в КПСС и был членом партии до её запрета в 1991 году.
С 1973 — сотрудник аппарата экономического советника посольства СССР в Индии.
С 1975 — Всесоюзное объединение «Тяжпромэкспорт».
В 1981 — Окончил ВАВТ .
С 1984 — заместитель начальника Главного управления поставок Госкомитета СССР по экономическим связям.
С 1988 — заместитель начальника, первый заместитель начальника Главного управления координации и регулирования внешних экономических операций Министерства внешнеэкономических связей СССР.
С 1991 — старший советник постоянного представителя России при отделении ООН и других международных организаций в Женеве, представитель России при организации «Генеральное соглашение по тарифам и торговле» (GATT).
С октября 1992 — заместитель министра внешнеэкономических связей России.
С октября 1993 — первый заместитель министра внешнеэкономических связей России.
С марта 1997 — и. о. министра внешнеэкономических связей и торговли России.
С апреля 1997 — министр внешнеэкономических связей и торговли России.
Сложил полномочия в марте 1998 в связи с отставкой Правительства Виктора Черномырдина и ликвидацией министерства.
В мае 1998 избран председателем совета директоров страхового общества «Ингосстрах», с февраля 1999 — генеральный директор компании.
В мае 1999 назначен министром торговли России в Правительстве Сергея Степашина.
В мае 2000 подал в отставку вместе со всеми членами Правительства России, 31 мая назначен первым заместителем секретаря Совета Безопасности России, курировал экономическую безопасность.
28 марта 2001 назначен директором Федеральной службы налоговой полиции России (ФСНП).
11 марта 2003 ФСНП упразднена, а Михаил Фрадков в мае 2003 назначен полномочным представителем России при Евросоюзе в ранге федерального министра. В этом качестве он был представлен на саммите Россия — Европейский союз 31 мая 2003 в Стрельне.
В июне 2003 назначен также специальным представителем Президента России по вопросам развития отношений с Евросоюзом.
В 2004—2007 годах занимал пост Председателя Правительства Российской Федерации.
Сменив своего предшественника Михаила Касьянова в марте 2004, Фрадков на посту Председателя Правительства РФ, по мнению многих аналитиков, был так называемым «техническим премьером», не проводившим самостоятельной политики. Все ключевые решения принимались администрацией президента РФ, считает заместитель гендиректора «Центра политических технологий» Алексей Макаркин.
Деятельность правительства Фрадкова была отмечена следующими мероприятиями:
14 ноября 2005 Владимир Путин ввёл две новые должности в Правительстве, тем самым ещё более урезав полномочия премьера. Руководитель администрации Президента России Дмитрий Медведев стал первым заместителем председателя, отвечающим за реализацию так называемых приоритетных национальных проектов, а министр обороны Сергей Иванов — заместителем председателя, курирующим оборону и оборонно-промышленный комплекс.
В 2006 году получил доход в размере 2,59 млн рублей, увеличив доход по отношению к 2005 году (1,8 миллиона) на 44 %.
12 сентября 2007 года на встрече с Президентом Российской Федерации Фрадков обратился к Владимиру Путину с просьбой об отставке Правительства, мотивируя её следующим образом: «Понимая, вот, происходящие политические процессы сегодня, я бы хотел, чтобы у вас была полная свобода в выборе решений, включая кадровые. И, я думаю, что правильно было бы, с моей стороны, выйти с инициативой освободить должность Председателя правительства для того, чтобы у вас не было никаких ограничений в принятии решений и устраивания, вот, властной конфигурации, в связи с предстоящими политическими событиями.»
Президент принял отставку Правительства и поблагодарил Фрадкова за достигнутые результаты в работе. Путин отметил такие достижения Правительства, как хорошие темпы роста экономики, снижение инфляции, рост реальных доходов населения, начало осуществления крупных социальных проектов. При этом президент предложил Фрадкову исполнять обязанности председателя Правительства вплоть до одобрения Госдумой кандидатуры нового премьера.
По опросу Фонда общественного мнения, проведённому после отставки Фрадкова с поста председателя Правительства, большинство россиян не смогли назвать никаких достижений (80 %) или неудач (75 %) в деятельности бывшего председателя правительства на своём посту. Ещё в ноябре 2005 года британские эксперты предсказывали уход Михаила Фрадкова с должности председателя правительства.
12 сентября 2007 года Фрадков подал президенту Путину прошение об отставке, которое было принято.
С 9 октября 2007 года — директор Службы внешней разведки Российской Федерации Был назначен на эту должность президентом Путиным вместо Сергея Лебедева, ставшего исполнительным секретарем СНГ.
Отец Михаила Фрадкова — еврей, а мать — русская. Некоторые СМИ утверждали, что Михаил Фрадков — сын Героя Советского Союза Ефима Борисовича Фрадкова (4 ноября 1921 — 5 ноября 1990), но сам Михаил Фрадков лично опроверг эту информацию.
Женат, имеет двоих сыновей. Супруга: Елена Олеговна, по образованию экономист, ранее работала ведущим специалистом по маркетингу Центра международной торговли, сейчас занимается домашним хозяйством. Старший сын, Пётр Фрадков (р. 1978), с января 2006 работает директором департамента структурного финансирования «ВЭБа». Младший, Павел (р. 1981), окончил Суворовское училище, но в армию не пошёл. После окончания училища Павел Фрадков поступил в Академию ФСБ РФ. В 2003 году поступил в Дипакадемию МИД РФ на факультет мировой экономики. В 2005 году принят в департамент общеевропейского сотрудничества МИД РФ на должность третьего секретаря.
М. Е. Фрадков запомнился россиянам, как и в свое время Георгий Маленков, подписанием правительственного постановления № 825 «О внесении изменений в правила регистрации российских граждан…» Постановление разрешило россиянину проживать в любой квартире без регистрации (прописки) 90 дней (а не 3 рабочих дня как было до того), резко увеличив свободу путешествий по России. Благодаря постановлению многие россияне перебрались на жительство в более благополучные регионы Российской Федерации. За 90 дней можно было выполнить процедуру регистрации, либо перебраться в другую квартиру на следующие 90 дней.