Родился 3 августа 1950 года в г. Сухуми в семье ветерана Великой Отечественной войны.
В 1975 году закончил Челябинский институт механизации и электрификации сельского хозяйства, получив специальность «инженер-педагог». Прошел армию, работал в Управлении народного образования г. Челябинска, где приобрел опыт руководящей деятельности и научной работы. В 1982 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Межпредметные связи на политехнической основе».
В 1983 году по приглашению руководства пединститута М.Н. Берулава переезжает в г. Бийск, где работает деканом физико-математического факультета, с 1986 года проректором по научной работе. В 1989 году он защищает докторскую диссертацию на тему «Интеграция содержания общего и профессионального образования».
В 1992 году М.Н. Берулава избирается членом-корреспондентом Российской академии образования, а в 1996 году – академиком РАО. Под его руководством создается Институт Прикладных проблем образования, который является одним из центров научно-исследовательской работы в Сибири.
В 1994 году Михаил Николаевич принимает участие в учредительной конференции Международной академии гуманизации образования, которая проходила в Германии. На этой конференции, в которой приняли участие ведущие ученые-педагоги более чем из 24 стран мира (США, Германии, Канады, Франции, Испании и др.), он избирается Президентом этой Международной академии. На базе Международной академии гуманизации образования издается Международный психолого-педагогический журнал «Гуманизация образования», главным редактором которого является М.Н. Берулава. После этого он избирается членом Союза журналистов России. В настоящее время данный журнал зарегистрирован в Париже и издается на европейских языках. В 1996 году Михаил Николаевич неоднократно приглашается с лекциями в европейские страны.
С 1996 года по направлению Министерства общего и профессионального образования и Российской академии образования Михаил Николаевич переезжает в город Сочи и возглавляет государственный Научно-образовательный Центр Российской академии образования. С этого же года М.Н. Берулава является экспертом Высшего Аттестационного Комитета России, с 1998 года – экспертом Комитета Совета Федерации по науке, культуре, образованию, здравоохранению и экологии Федерального Собрания России.