С 1994 года председатель Комитета по управлению городским имуществом (КУГИ) Санкт-Петербурга (и. о. с 1993 года), с 1996 года одновременно вице-губернатор Санкт-Петербурга. Убит в 1997 году.
Отец — Владислав Моисеевич Маневич, профессор Санкт-Петербургского государственного университета экономики и финансов, заведующий лабораторией социально-экономических проблем образования и занятости Центра научных исследований, заслуженный работник высшей школы РФ. Мать — Мета Михайловна Маневич.
Окончил с отличием Ленинградский финансово-экономический институт им. Н. А. Вознесенского (1983). Кандидат экономических наук (тема диссертации: «Управление в социальных и экономических системах»).
В 1980-х годах входил в круг ленинградских экономистов-реформаторов, неформальным лидером которых был Анатолий Чубайс; в 1987 году был членом клуба «Синтез» при Ленинградском дворце молодежи, в который входили молодые ленинградские экономисты и обществоведы, среди которых: Дмитрий Васильев, Михаил Дмитриев, Андрей Илларионов, Борис Львин, Алексей Миллер, Андрей Ланьков, Андрей Прокофьев, Дмитрий Травин и другие.
В 1990 году баллотировался на выборах народных депутатов РСФСР и депутатов Ленсовета, был поддержан блоком «Демократические выборы-90»; проиграл в повторном голосовании (на выборах народных депутатов РСФСР — другому кандидату блока Никите Толстому).
С 1992 года работал в Комитете по управлению городским имуществом (КУГИ) Санкт-Петербурга.
Идеолог принятой в декабре 1994 года концепции управления недвижимостью Санкт-Петербурга, согласно которой государство не может быть эффективным собственником, а должно устанавливать единые для всех правила игры; в результате Санкт-Петербург приобрёл на некоторое время репутацию региона с самым продвинутым в системном отношении рынком недвижимости.
Занимался разработкой законодательства по приватизации и государственных программ приватизации, жилищно-коммунальной реформы на федеральном уровне.
18 августа 1997 года в 8.50 утра служебный автомобиль «Вольво», в котором находились водитель, Маневич (на переднем сиденье) и его жена (на заднем сиденье), притормозил, выезжая с улицы Рубинштейна (где жил Маневич) на Невский проспект. После этого с чердака дома на противоположной стороне (Невский, 76) раздались выстрелы. Михаил Маневич был ранен пятью пулями в шею и грудь, по дороге в больницу он скончался; его жена получила лёгкое касательное ранение. Убийца скрылся, оставив автомат Калашникова югославского производства с оптическим прицелом.
В 2005 году в годовщину убийства Анатолий Чубайс заявил:
29 ноября 2006 года Чубайс заявил: «Всё, что я обещал на могиле Маневича, я выполнил слово в слово: все организаторы убийства сидят пожизненно, ни один из них не выйдет». Наблюдатели связали это заявление с тем, что 21 ноября Верховный суд РФ оставил в силе пожизненные приговоры, вынесенные Юрию Шутову и четырём членам его банды.
Официально на тот момент убийство не было раскрыто, следствие по делу неоднократно продлевалось.
В ноябре 2009 года в убийстве Михаила Маневича сознался Алексей Гардоцкий, находящийся под следствием по делу банды Сергея Зарипова — бригадира ОПГ, подконтрольной Юрию Шутову. Гардоцкий подробно рассказал, как происходила подготовка к убийству и само убийство. По его словам, убийство готовилось несколько месяцев под руководством брата Сергея Зарипова — Андрея Зарипова. В день убийства он, стоя на улице Рубинштейна, по радиостанции подавал команды Гардоцкому, который находился на чердаке дома на Невском проспекте и стрелял в Михаила Маневича из автомата Калашникова. Еще двое соучастников отслеживали выезд вице-губернатора из дома.
Михаил Маневич был похоронен на Литераторских мостках Волковского кладбища. 18 февраля 1999 года на его могиле установлен памятник — расколотый шар, прошитый пулями. Авторы проекта памятника — архитектора Вячеслав Бухаев и скульптор Михаил Шемякин.
На улице Рубинштейна (д. 2), недалеко от места гибели Маневича, 18 августа 2002 года была установлена мемориальная доска (скульптор Светлана Серебрякова) — вертикальная доска из малинового кварцита с барельефом Маневича и надписью: «В память выдающемуся экономисту, вице-губернатору Санкт-Петербурга», под барельефом — сломанная линия.
В 1998 году имя Маневича присвоено школе № 249, где он учился. 15 октября 2009 года здесь был открыт музей имени Михаила Маневича.
6 марта 2008 года безымянному скверу по Щербакову переулку присвоено имя Маневича. 18 февраля 2011 года, в день 50-летия со дня рождения Маневича, в сквере состоялась церемония установки закладного камня на месте будущего памятника.