Микаил Рагимов родился 26 сентября 1930 года в селе Тумаслы Шарурского района Нахичеванской АССР Азербайджанской ССР.
В 1958 году окончил Пермский сельскохозяйственный институт по специальности зоотехния.
В 1958—1961 годах работал главным зоотехником конного завода, директором Суксунской межрайонной племенной станции Пермской области. В 1961—1964 годах — аспирант Пермского СХИ. В 1964—1970 годах — доцент, заведующий кафедрой, декан зоотехнического факультета Тюменского СХИ. С 1970 по 1985 год работал заведующим отделом Сибирского научно-исследовательского и проектно-технологического института животноводства.
С 1987 года — директор Азербайджанского НИИ животноводства им. Ф. А. Меликова.
Имеет звание доктора сельско-хозяйственных наук (1985), профессора (1986), члена-корреспондента ВАСХНИЛ (1991) и члена-корреспондента НАНА (2001).
В 1985 году Микаилу Рагимову была присуждена Премия министерств СССР за разработку и внедрение промышленных технологий производства продуктов животноводства на основе реконструкции ферм крупного рогатого скота в Сибири.
Научные исследования Рагимова посвящены проблемам кормления и содержания животных, технологии производства продуктов животноводства. В своих работах большое внимание уделяет структуре рационов и их влиянию на мясную продуктивность и анатомо-морфологические особенности животных. Проводит сравнительное изучение влияния способов содержания молодняка на его откормочные и мясные качества. При непосредственном участии М. И. Рагимова были разработаны промышленные методы производства говядины в Сибири, теоретические и практические основы реконструкции ферм крупного рогатого скота.
Микаил Рагимов — автор 152 опубликованных научных работ. Под его руководством подготовлено 14 кандидатов и 1 доктор наук.