В 1931 году М. Бэббит поступает на математический факультет Пенсильванского университета, затем продолжает своё образование в Нью-Йорке. После получения диплома изучает композицию, в том числе под руководством Роджера Сешенса. Во время Второй мировой войны некоторое время преподавал математику в Принстонском университете, в дальнейшем занимался исключительно музыкой. Начиная с 1950 года он участвует в работах по созданию первого музыкального синтезатора. В 1959 году он становится одним из основателей Columbia-Princeton Electronic Music Studio. Преподавал в различных университетах, в том числе в Принстонском, профессор композиции в Джульярдской школе.
М. Бэббит является одним из первых композиторов, работавших в областях электронной музыки и сериализма. За свой вклад в музыкальное искусство был в 1982 году награждён Пулитцеровской премией.