Академик-секретарь Отделения общей биологии Национальной академии наук (НАН) Украины, директор Института физиологии растений и генетики НАН Украины, президент Украинского общества физиологов растений, экс-президент Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова, лауреат Государственных премий в области науки и техники Украины, СССР, УССР, премии НАН Украины им. В.Я. Юрьева, премии президентов академий наук Украины, Белоруссии и Молдовы, Заслуженный деятель науки и техники Украины, доктор биологических наук, профессор, академик НАН Украины.
Родился 10 марта 1938 года в с. Новоселица Чигиринского района Черкасской области.
Закончил Знаменский сельськохозяйственный техникум и агрономический факультет Украинской сельськохозяйственной академии. За отличные успехи в обучении был удостоен стипендии им. В. И. Ленина.
Свою научную деятельность начал еще студентом. В 1964—1967 годах учился в аспирантуре УСХА по специальности «генетика».
С 1974 года В. В. Моргун возглавил отдел экспериментального мутагенеза в Институте молекулярной биологии и генетики АН УССР.
В 1986 году его выбрали директором Института физиологии растений АН УССР, который после объединения с генетическими отделами Института молекулярной біологии и генетики был реорганизован в Институт физиологии растений и генетики НАН Украины.
В 1980 году Владимир Васильевич защитил докторскую диссертацию. В 1985 его выбрали членом-корреспондентом АН УССР, в 1990 — академиком АН УССР, а в 2009 — академиком-секретарем Отделения общей биологии НАН Украины.