В 1200-м году становится крон-принцем. Становится Императором после отречения от престола Императора Цутимикадо под нажимом отца, Императора Го-тобы, однако фактически от имени Дзюнтоку продолжает править Император Го-тоба (инсэй).
В 1221 его заставили отречься от власти после попытки его отца свергнуть сёгунат Намакуры (война Дзёкю).
После этого инцидента был сослан на остров Садо, где и умер в 1242.
Третий сын Императора Го-Тобы. Мать: Сигэко (??), дочь Фудзивары Ханки (????)
Получил посмертный титул Садо-но-ин (???) по названию острова Садо, где провёл последние годы жизни.