Родился в семье крестьянина. Окончил техникум механизации, почле чего работал на МТС. В армии с 1938 года. Окончил школу младших командиров.
Участвует в Великой Отечественной войне с 1941 года, тогда же окончил курсы младших лейтенантов.
7 октября 1943 года при форсировании реки Днепр под огнём противника организовал сборку парома и провёл его с десантом на другой берег.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 17 октября 1943 года, Немцеву Семёну Ивановичу было присвоено звание Героя Советского Союза.
В отставке с 1947 года. Работал на машиностроительном заводе в городе Ступино.
Умер 20 ноября 1978 года. Похоронен в селе Лужники Ступинского района Московской области.