Футбольную карьеру Мастроени начал в футбольной команде Государственного Университета Северной Каролины. В 1998 году он был задрафтован под общим тринадцатым номером командой «Майами Фьюжн», за которую он впоследствии выступал четыре года, вплоть до расформирования команды. В 2002 году в результате драфта распределения Мастроени оказался в клубе «Колорадо Рэпидз», за который выступает и по сей день.
В национальной сборной Мастроени дебютировал в июне 2001 года в матче с Эквадором. На сегодняшний момент провёл за сборную 63 матча. Был в составе сборной США на двух чемпионатах мира, в 2002 и 2006 годах.