Родился в Волосе. Был митрополитом Фиваидским. В течение семнадцати лет жил в России в качестве представителя Александрийского патриархата. В России руководил сбором средств для Александрийского Патриархата. В общей сложности было собрано и отправлено в 1859 году 48 580 рублей.
Находился в России, когда в 1866 году был избран Патриархом Александрийским. Трудная ситуации из-за внутренних проблем патриархата, привело к беспрецедентному шагу, когда патриарх объявил архимандрита Евгения «заместителем и преемником» и удалился в монастырь св. Саввы. Это вызвало интенсивный внутренний конфликт в Церкви в Александрии, который привёл к отставке Никанора с патриаршего престол 19 марта 1869 года. В 25 декабря 1869 года он умер.