Профессионал с 1991 года. Завершил карьеру в 2002 году.
Выиграл 11 турниров в одиночном (в том числе 2 турнира Большого Шлема и 2 турнира серии Мастерс) и 10 турниров в парном разряде (в том числе 1 турнир Большого Шлема и 2 турнира серии Мастерс).
Лучшие результаты в турнирах «Большого шлема»:
Рафтер доходил как минимум до полуфиналов всех 4 турниров Большого шлема как в одиночном, так и парном разрядах.
Трижды подряд (1998, 1999, 2000) Рафтер побеждал на турнире Ordina Open в голландском Хертогенбосе.
26 июля 1999 года занял первую строчку в рейтинге АТП, но сохранить звание первой ракетки мира смог всего лишь одну неделю — самый короткий срок среди всех обладателей этого титула. Рафтер не провёл ни одного матча в статусе первой ракетки мира.