Работал вместе с Донато Браманте и Рафаэлем на вилле Фарнезина. После смерти Рафаэля возглавлял работу по строительству Собора Святого Петра в Риме. Его последней постройкой стал Palazzo Massimo alle Colonne в Риме (1532-1536).
Перуцци погребен в римском Пантеоне рядом с могилой Рафаэля.
Кисти Перуцци принадлежат фрески в Санта-Мария-делла-Паче, Палаццо Мадама, римских церквах Сант-Онофрио-аль-Джаниколо, Сан-Пьетро-ин-Монторио и Сан-Рокко.
Рисунок Перуцци «Андрокл и лев», написанный по мотивам сказаний о рабе Андрокле находится в собрании Государственного Эрмитажа.