Семья Жубера имела французские корни: его предки, будучи гугенотами, после отмены Людовиком XIV в 1685 году Нантского эдикта сначала перебрались в Нидерланды, а затем переселились в Капскую колонию.
Жубер родился в Капской колонии, а потом с отцом переехал в Натал, в 1847 году — в Трансвааль. В 1852 году сражался с Сечеле, правителем баквена, относящихся к этнической общности тсвана. Избранный в фольксраад, Жубер стал его президентом. В 1881—1882 гг. с успехом сражался с англичанами. В 1893 и 1898 годах был кандидатом «прогрессивной» партии на пост президента республики, но не был избран; в 1898 избран вице-президентом (при президенте Крюгере).
После того, как буры Трансвааля в 1895 году окружили и взяли в плен отряд Джеймсона, планировавшего поднять в Трансваале восстание «ойтландеров». Жубер руководил постройкой укреплений в стране на случай войны. Был сторонником уступок требованиям Англии и в связи с этим конфликтовал с П. Крюгером. Тем не менее во время войны с Англией он был назначен командующим вооруженных сил Трансвааля. Но в ведении боевых действия он не проявлял инициативы и свои главные силы сосредоточил вокруг осажденного Ледисмита. Это было ошибкой, так как время, когда было возможно оккупировать Натал, было упущено, и англичане смогли перебросить необходимые подкрепления. После его смерти командование бурскими отрядами в Натале было возложено на Л. Боту.
Леонид Покровский, российский офицер и доброволец, сражавшийся на стороне буров, следующим образом описывал П. Жубера: