Училась в Севилье, Мадриде, Париже и Брюсселе. Как исполнительница предпочитала произведения Бетховена, Шопена, Шумана. Наиболее известна педагогической деятельностью: с 1896 года преподавала в Мадридской консерватории. Среди учеников Пилар Фернандес были, в частности, Хосе Кубилес и Хулиан Баутиста.