Дебютировал в ноябре 1992 года.
В августе 1998 Айяла проиграл в Японии техническим решением в 6-м раунде чемпиону мира в легчайшем весе по версии WBC японцу Джойчиро Татсуюоши.
В июне 1999 года Поли Айяла вышел на ринг против непобеждённого чемпиона мира в легчайшем весе по версии WBA Джонни Тапии. Бой получился зрелищным — оба боксёра постоянно шли вперёд, вступая в размен. По итогам 12-ти раундов судьи близким решением объявили победителем Поли Айялу. Поединок получил статус "бой года" по версии журнала "Ринг".
В октябре 1999 года Айяла победил по очкам Саохина Сритая Кондо.
В марте 2000 он победил решением большинства Джимми Бредаля.
В октябре 2000 года состоялся 2-й бой между Поли Айялом и Джонни Тапией. Айяла вновь победил единогласным решением судей.
В марте 2001 года он победил по очкам Хьюго Данзо.
В ноябре 2002 года Айяла в бою за вакантный титул чемпиона мира в полулёгком весе по версии WBC проиграл по очкам Эрик Моралес.
В июне 2004 года он проиграл по очкам Марко Антонио Баррере. После этого Тони Айяла ушёл из бокса.